Aliağa'da ve bu bölgede geniş toprakları olan Baltazzi ailesi 1876'da Aliağa Çiftliği'nde 12 bin m2'lik bir bahçenin içine 3 katlı bir konak yaptırmıştır. Bu konağın üçüncü katı, İngiliz savaş gemilerinin kıyıyı top ateşine tutması sonucu yıkılır. 1917-1924 yılları arasında yöredeki Rumlarla, Yunanistan'daki Türklerin yer değiştirmesi sırasında bu yapı bir süre gelen mübadil ailelere mesken olarak tahsil edilir. O yıllarda bu eski konağın okul olarak kullanılabileceği düşünülmektedir.
Cumhuriyetimiz 10. Yılına ulaşırken, ülkede hızlı bir okullaşma hareketi ve yeni yazı ile okuma-yazma seferberliği başlatılır. Bugünkü Atatürk İlkokulu'nun bahçesinde bulunan Baltazziler'in (Baltacı) Konağı, zamanın İzmir Valisi Kazım Dirik Paşa'nın girişimleri ve katkılarıyla bakımı yapılarak okul binasına dönüştürülür. Okul, 1933-1934 öğretim yılında Aliağa İlkokulu adıyla 5 yıl süreli öğretim verilmek üzere hizmete açılır. Kemal Bey yeni okulun da başöğretmeni olarak atanır.
Aliağa İlkokulu, 1933-34 eğitim öğretim yılına 44 kız, 66 erkek olmak üzere toplam 110 öğrenci ve 3 öğretmenle eğitime başlar. İlk yıl 1. 2. 3. sınıflarda öğretim yapılmıştır. Beş yıl öğretim gören ilk öğrenciler 1935-36 yılında mezun olurlar. Bunların sayısı sadece üç kişidir.
1935-36 eğitim öğretim döneminde 5 sınıf olarak eğitim veren Aliağa Mektebinde 151 öğrenci vardır.
Aliağa İlkokulu, nahiye merkezi içinde 1968'e kadar kültürel çalışmalar ve eğitim öğretim hizmetlerini tek eğitim kurumu olarak üstlenir.
1960'ların sonunda Aliağa'da başlayan sanayileşme ve toplumun hareketlenmesi ile yeni okullara ihtiyaç duyulmaktaydı. 1968 yılında Kurtuluş Mahallesi'nde Namık Kemal İlkokulu açıldı. İkinci bir ilkokulun açılmasıyla Aliağa İlkokulu'na özel bir isim verilmesi gerekti. Ona en çok yakışanı da "ATATÜRK" olacaktı kuşkusuz.
1968-1969 öğretim yılına Atatürk İlkokulu adıyla başladı okulumuz. 1967-1968 yılında Atatürk İlkokulu'nda bir ortaokul sınıfı başlar.
1972 yılına gelindiğinde Baltazzilerin okul olarak kullanılan binasının yıkılarak yerine yeni bir okul yapılmasına karar verilir. 120 yıllık tarihi bina 1972 'de yıkılır; hemen yanı başına inşa edilen yeni binada 1973-74 ders yılında eğitim faaliyeti devam eder. Yıkılan tarihi binanın yeri betonla kaplanarak üzerine voleybol sahası yapılır.
1997 yılında eğitim sisteminde yapılan önemli bir değişiklikle ilkokullar devrini tamamlamış ve 8 yıllık kesintisiz eğitim uygulamasına geçilmiştir. Bu yıldan itibaren Atatürk İlkokulunun yeni adı Atatürk İlköğretim Okulu olur ve yeni sistem gereği 1997, 1998, 1999 yıllarında mezun vermez.
Atatürk İlkokulu/İlköğretim Okulu, 1933'den 2002 yılına kadar 3945 öğrenciyi ilkokul, 220 öğrenciyi ilköğretim düzeyinde eğiterek mezun etmiştir.